专业工程施工合同是指发包人与承包人就特定工程项目达成的协议，受《合同法》和《建筑法》规范。合同应明确工程范围、质量标准、工期和价款。
签订时，需注意资质审查、招标程序和合同形式。专业工程往往涉及技术复杂性，因此条款中应包含设计变更、材料供应和验收标准。
履行过程中，承包人须按约定施工，发包人提供必要条件。若发生延误或质量问题，可通过协商或仲裁解决。
风险防控包括设置违约责任条款、保险安排和进度款支付机制。同时，建议保留施工日志和证据，以应对潜在诉讼。
在纠纷发生时，可依据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》主张权利，确保合法权益。